O Campeonato Gaúcho de Futebol de 1939, foi a 19ª edição da competição no Estado do Rio Grande do Sul. Mais uma vez Grêmio e Internacional não estiveram participando do campeonato. A fórmula de disputa entre os campeões das regiões foi mantida. O Rio-Grandense de Rio Grande foi o campeão.
Na semifinal da Região Sul, entre Pelotas e Riograndense, houve uma polêmica. Depois de três jogos, os dois clubes permaneciam igualados, com uma vitória do Pelotas em Rio Grande (2x1), uma vitória do Riograndense em Pelotas (2x1) e um empate no campo do São Paulo de Rio Grande (1x1) [1]. Foi marcada uma quarta partida em Bagé, mas houve dúvidas sobre em que estádio ela deveria ser disputada; no dia marcado, o Riograndense compareceu ao campo do Ferroviário, enquanto que o Pelotas foi ao estádio do Guarany [2]. A FRGF ainda tentou marcar uma nova data para a decisão (dia 12 de novembro, em Porto Alegre), mas o Pelotas se recusou a prosseguir na competição.
Assim, o Riograndense chegou à final do Campeonato contra o Grêmio Santanense e sagrou-se campeão ao final de uma "melhor de três", com uma vitória e dois empates. O Grêmio Santanense ficou com o vice-campeonato.