As quatro equipes disputarão jogos de ida e volta entre si e se classificam para a fase final os dois melhores times.
Fase Final
A fase final definiu o campeão e o vice em duas partidas, ambas equipes garantiram o acesso à 1ª Divisão de 2017.[1]
A Associação vencedora do confronto Final da Fase Final será declarada Campeã do Campeonato Piauiense de Futebol - Segunda Divisão de 2016 e será a primeira representante da 1ª Divisão de 2017.
A Associação que ficar na segunda posição do confronto Final da Fase Final será declarada Vice-Campeã do Campeonato Piauiense de Futebol - Segunda Divisão de 2016 e será a segunda representante da 1ª Divisão de 2017.