ICE (CRISPR)

Este artigo faz parte de uma série sobre CRISPR
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ICE, (abreviatura de Inference of CRISPR Edits), Inferência de Edições CRISPR (em português) é uma ferramenta de software livre e de código aberto que oferece análise rápida e confiável de dados de edição CRISPR.^[1] Este software não requer alteração manual de configurações ou parâmetros.^[2]

Operação

Basta carregar seus dados de sequenciamento Sanger no ICE para ver a frequência total indel, a frequência relativa de cada indel, uma pontuação nocaute (KO) que revela a proporção de indels capazes de gerar mutações completas de perda de função e diferenças totais entre os editados e os selvagens digite seqüências.^[3]

Referências

↑ Stoner, Rich; Enzmann, Brittany L.; Holden, Kevin; Kelso, Reed; Yang, Joyce; Waite, Kelsey; Maures, Travis; Conant, David; Hsiau, Tim (14 de janeiro de 2019). «Inference of CRISPR Edits from Sanger Trace Data». bioRxiv (em inglês). 251082 páginas. doi:10.1101/251082
↑ «Analyzing CRISPR Editing Results». GEN - Genetic Engineering and Biotechnology News (em inglês). 31 de maio de 2018. Consultado em 10 de julho de 2019
↑ «Synthego | Full Stack Genome Engineering». www.synthego.com (em inglês). Consultado em 10 de julho de 2019

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[1] Stoner, Rich; Enzmann, Brittany L.; Holden, Kevin; Kelso, Reed; Yang, Joyce; Waite, Kelsey; Maures, Travis; Conant, David; Hsiau, Tim (14 de janeiro de 2019). «Inference of CRISPR Edits from Sanger Trace Data». bioRxiv (em inglês). 251082 páginas. doi:10.1101/251082

[2] «Analyzing CRISPR Editing Results». GEN - Genetic Engineering and Biotechnology News (em inglês). 31 de maio de 2018. Consultado em 10 de julho de 2019

[3] «Synthego | Full Stack Genome Engineering». www.synthego.com (em inglês). Consultado em 10 de julho de 2019

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